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Analyses of ribosomal sequences and biotechnological potential as sources of C-phycocyanin in one Chilean strain of Spirulina and two foreign strains of Arthrospira (Cyanophyceae)
p. 185-198 |
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Alejandra BARRIGA / Patricia I. GOMEZ / Mariela A. GONZALEZ / Rolando MONTOYA |
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| We used Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis (ARDRA) and sequencing to genetically characterize one Chilean strain of Spirulina (S. subsalsa CONC-050) and two foreign strains of Arthrospira (A. maxima CONC-040 and A. platensis M2). The potential of the strains as a source of the pigment C-phycocyanin (C-PC) was also evaluated. Restriction fragment profiles of the ribosomal internal transcribed spacer (ITS) from A. maxima CONC-040 matched those of the one previously well characterized Arthrospira clade (clade II) of Scheldeman et al. (1999). The ITS sequence of Spirulina was interrupted by the tRNAIle gene while the ITS regions of Arthrospira were interrupted by both tRNAIle and tRNAAla genes. Phylogenetic analysis, including ITS sequences from other strains deposited in GenBank, showed that the ITS region of S. subsalsa CONC-050 is almost identical to the previously sequenced S. subsalsa FACHB351. In relation to the Arthrospira group, A. maxima CONC-040 was reconfirmed as a member of cluster II, while A. platensis M2 was the most divergent and did not group with any other Arthrospira strain. C-PC content was significantly higher in S. subsalsa CONC-050. Antioxidant capacity was evaluated in aqueous extracts containing the same quantity of C-PC. The most protective extract was the one from A. maxima CONC-040, which was the strain that was less productive in terms of C-PC per culture volume. |
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ARDRA / Arthrospira / C-Phycocyanin / Phylogenetic analysis / Ribosomal sequences / Spirulina |
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Analyses des séquences ribosomales et du potentiel biologique comme sources de phycocyanine-C d'une lignée chilienne de Spirulina et de deux lignées étrangères d'Arthrospira (Cyanophyceae). Une lignée chilienne de Spirulina (S. subsalsa CONC-050) et deux lignées étrangères d'Arthrospira (A. maxima CONC-040 et A. platensis M2) ont été caractérisées à l'aide de la technique ARDRA (Amplified Ribosomal DNA Restriction Analysis), leurs séquences ont été analysées. En outre, leur potentiel comme source de phycocyanine-C (C-PC) a été évalué. Les profils des fragments de restriction des espaceurs ribosomaux internes transcrits (ITS) de l'Arthrospira maxima CONC-040, s'apparentent à ceux de l'Arthrospira clade (clade II) de Scheldeman et al. (1999). Les séquences ITS de la Spirulina ont été interrompues par le gène ARNtIle tandis que les régions ITS de l'Arthrospira ont été interrompues par les gènes ARNtIle et ARNtAla. L'analyse phylogénique, incluant les séquences ITS chez d'autres lignées présentes dans GenBank, a montré que la région ITS du S. subsalsa CONC-050 est presque identique à celle du S. subsalsa FACHB351, déjà décrite. Au sein des Arthrospira, l'A. maxima CONC-040 a été re-confirmé comme un membre du cluster II, tandis que l'A. platensis M2 se montre très divergent, en ne se regroupant pas avec une autre lignée d'Arthrospira. Le contenu de C-PC a été significativement élevé dans le S. subsalsa CONC-050. La capacité anti-oxydante a été évaluée à partir d'extraits aqueux contenant la même quantité de C-PC. L'extrait le plus protecteur a été celui provenant de l'A. maxima CONC-040, qui a été la lignée moins productive en termes de C-PC par volume de culture. |
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